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ムービークリップのscriptからメインタイムラインの関数実行をするとき、

._root.関数名で実行出来ます。（ActionScript2.0）

メインタイムラインに記述されたscript

function hoge(){
trace("ほげ");
}

ムービークリップに記述されたscript

_root.hoge();

これで呼び出しが可能です。

ActionScript3.0の場合は

MovieClip(root).hoge();

となります。