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通常、flashから生成された、swfファイルは

背景として扱うことは出来ないのですが、

次の方法で可能となります。

HTML

<div id="content">
<!-- ここにHTMLのページコンテンツ -->
上に表示させるコンテンツ
</div>
<div id="flash">
<object classid="clsid:d27cdb6e-ae6d-11cf-96b8-444553540000">
<param name="movie" value="main.swf" />
<param name="wmode" value="transparent" />
<embed src="main.swf" wmode="transparent" type="application/x-shockwave-flash" />
</object>
</div>

CSS

#content {
position: relative;
z-index: 1;
}
#flash {
position: absolute;    /*#contentの後ろ側にwidth100%で配置*/
z-index: 0;
top: 0;
left: 0;
width: 100%;
height: ○○px;
}

強引ではありますが、

<param name="wmode" value="transparent" />

と

<embed src="main.swf" wmode="transparent" type="application/x-shockwave-flash" />

部分に wmode=”transparent”を追加し、position: absolute; で z-index: 0; を指定することによって、
背景として扱う事が可能です。